广西中医药大学的办学基础为1934年成立的广西省立南宁区医药研究所，建校于1956年，1958年更名为广西中医专科学校，1964年升格为广西中医学院，1970年南宁医学专科学校并入，2012年3月经国家教育部批准正式更名为广西中医药大学，是国家中医药管理局与广西壮族自治区共建高校、国家中西部基础能力建设高校。