武汉交通职业学院办学始于1953年，2003年由交通运输部直属的武汉交通管理干部学院、武汉水运工业学校合并组建而成，隶属于湖北省教育厅。2010年，教育厅、交通运输部长江航务管理局签订协议，共建武汉交通职业学院。