保山中医药高等专科学校的前身，是创建于1965年6月的国家级重点中专保山卫生学校，2006年2月经教育部批准升格为云南省唯一一所中医药学科特色鲜明、中西医专业协调发展的公办全日制普通高等专科学校。学校于2011年通过高职院校人才培养工作评估；2014年通过公共体育课程教学评估；2016年通过特色评估；2017年整体搬迁新校区办学，并通过思想政治理论课建设评估，护理专业在云南省高校护理高职教育专业评估中获五星A级排名第一；针灸推拿专业和临床医学专业教师教学创新团队入选云南省第一批职业教育教师教学创新团队立项建设单位；2022年立项为省级“双高”学校培育单位。