闽南理工学院创办于1998年，经国家教育部批准于2008年升格为普通本科高等学校。2012年获学士学位授予权单位。2016年通过教育部本科教学工作合格评估。2025年1月，获批硕士学位授予培育单位立项建设高校。2025年5月，接受教育部本科教育教学审核评估。