白城医学高等专科学校始建于1958年，建校时为省管医学专科学校，1962年下放地方并调整为全日制中等专业学校，2002年与吉林省粮食学校合并，2004年经教育部批准恢复医学高等专科学校，同年附属医院划入，2011年上划省属高校，2025年白城中心医院（三甲）划归学校，成为学校直属附属医院。1985年起，相继与原白求恩医科大学、吉林大学等高校开展联合办学，建立白求恩医科大学白城分校、吉林大学白城医学院。