北部湾大学前身为1973年创办的钦州地区师范学校；2006年2月，教育部批准学校升格为钦州学院；2018年3月，国务院学位委员会批准学校成为硕士学位授权单位；2018年11月，教育部批准在钦州学院基础上设立北部湾大学。中央和自治区党委政府高度重视和支持北部湾大学建设，国务院和自治区政府在各种文件中多次强调要加快支持北部湾大学建设，助力培养高质量的海洋、航海类人才。